そこで'99年度から旧準備部のメンバーを初代部長とした「企画部」という新組織が発足した。企画部は企画部長を含め6名の教師で構成され、生徒募集、進路指導、授業改善など学校運営全般に対する様々な新しい取り組みを実行するための“コントロールタワー”としての存在となっている。
　現在の企画部長・奥山誠先生は3年前に同校に赴任し、企画部のメンバーとなった。
　「堀川高校に来た時は、学校全体に『みんなで新しい堀川をつくるんだ』という雰囲気を強く感じました。また、相互評価、自己点検が活発に行われていました。ややもすると我々教師は他教科の教師と授業についてあまり意見交換をしないものですが、そうならないように意識的に先生同士が意見を言い合う土壌をつくっていこうとしていました。お互い言いたいことを率直に言うものですから、今でも思わず熱くなってしまうことも少なくありません」（奥山先生）
　例えば、模試のたびに結果の分析会が開かれる。ある教科の成績が落ち込んでいる場合には、学年団とともに企画部が「生徒の弱点強化にどう取り組むか」を教科に問うことになる。
　「学校を今よりもっと良くするためには、ただでさえ忙しい現状に、これ以上仕事を増やすような提案もしていかなければなりません。思うことは遠慮無く積極的に口に出して、議論する中で、より良い形になっていけばと思っています」（奥山先生）
　「企画部の仕事の多くは、教職員にもっと仕事をしてくれと要求することなのです。他の教職員もそれが企画部の仕事だと分かっています。これは大変だから言わないでおこうかとか、これ以上やるのは無理かなとか、そういう遠慮はよくない。常に向上を目指して挑戦し続けたいと思います」（荒瀬先生）
　自由に意見を述べ合うことで、時には、互いの感情を損ねてしまうこともある。「学校を良くしたい、生徒を良くしたいという共通の目標を確認しながら、丹念に時間をかけて解決していきます。ぶつかり合いを恐れてはいけないと思います」と荒瀬先生は言う。